Primavera de 1901: una epidèmia de pesta fa estralls entre els habitants de lilla de Minguer, 29a província de limperi Otomà. El sultà Abdülhamit primer hi envia el seu inspector en cap de salut, el químic Bonkowski Paixà, i el jove i exitós doctor Nuri, que viatja acompanyat de la seva dona, Pakize Sultan, neboda del sultà. A lilla també hi trobaran el jove oficial otomà Major Kâmil; la illenca Zeynep, de qui aquest últim està enamorat; el governador Sami Paixà, desbordat per la situació, i la seva bella amant Marika. Nits de Pesta és la història daquests personatges, de les relacions que sestableixen entre ells, del seu esforç constant per fer complir les prohibicions de la quarantena imposada i de la guerra contra lepidèmia, les tradicions de lilla i, finalment, les friccions sorgides davant lamenaça de la mort.
